青海湖环湖地区的草场已于1984年全部承包到户，承包政策50年不变，为了便于管理，牧民都将各自的草场用网围栏圈了起来，草场上的网围栏成为普氏原羚保护工作当中最大的障碍，使保护工作难以正常开展。因此，普氏原羚的生存要承受围栏、狼害、植被退化、人类活动、水源缺乏、疾病等多方面的压力，部分种群数量则面临着灭绝的危险。造成普氏原羚栖息地面积缩小的主要原因是：公路、铁路、围拦、家畜和民用建筑。
      总的来说，栖息地就是一个物种赖以生存、以及交配、繁殖、觅食、自由活动的自然环境和自由空间，在这个自然环境当中，一个物种的栖息地，可以是一个相对稳定、能保证这个物种生命安全的生态系统，还要包括食物链中各种植物种的生存需要。
      由于社会的不断发展和人类的各种活动，造成了目前普氏原羚栖息地环境的日益恶劣。在半个世纪前，青海湖环湖地区普氏原羚分布区是连成一片的整体，如今，由于农田、村庄、围栏、铁路、公路、旅游等各种因素的干扰和阻隔，普氏原羚栖息地已经支离破碎，种群之间彼此隔离，使过去的一个大种群被分隔成现在的多个局部小的种群。为了避免牧民之间对草场问题的冲突，促进牧业的发展，政府制定了牧民拉围栏建设的相关政策，并从经济上支持牧民建造围栏。但是，这种情况对于现在残存的普氏原羚的栖息地造成了很大的威胁，栖息地面积逐年减少，栖息地内不同类型的三种围栏阻挡了普氏原羚的正常生活规律，家畜过载，栖息地沙化严重，食物的质量和数量每况愈下。围栏的加高和加密，最大程度上阻档了普氏原羚的正常活动，对于天敌狼的捕猎带来了方便，普氏原羚跳越围栏时，很容易被挂在围栏上，直到死亡为止。围栏的增加，导致了普氏原羚死亡数量的上升和栖息地的不断破碎化，普氏原羚面临着灭绝的风险，目前，普氏原羚主要分布在青海湖湖东和湖北地区，种群之间相距较远，无法进行基因交流，都是属于近亲交配繁殖，成活率低，种群数量仍然没有得到恢复。通过调查，发现普氏原羚面临着生存环境不断恶化和种群数量增长缓慢等严重的危机。
      据2007至2009年的调查，青海湖周边地区普氏原羚栖息地总面积约在1459平方公里，部分区域栖息地面积特别小。普氏原羚栖息地内生长有麻黄、芨芨草、沙生针茅、狼毒等植物，栖息地以青海湖畔半沙漠化和芨芨草滩为主。由于栖息地区域植物单一、围栏加高加密、牲畜数量超载、人类活动加剧，加剧了环湖地区生态状况的日益恶化，使普氏原羚栖息地面积和活动范围不断减少。