祁连山区多年冻土分布在海拔3 400 m以上，此海拔以下目前还没有发现多年冻土的报道。多年冻土分布具有明显的高度地带性特征，祁连山多年冻土区纬度范围为37。40＇～39。50＇N。随着纬度升高，海拔随之增加，在高度和纬度因素的共同影响下，多年冻土分布的连续性加强，逐步从岛状冻土区向片状冻土区过渡，最后进入连续多年冻土区，连续性多年冻土发育的最低海拔3 600 m。受降水自东向西递减这一规律的影响，多年冻土下界呈现出自西向东倾斜的趋势(图1)，随经度向东增加，下界海拔降低，变化率大约为每度150 m。根据程国栋等对中国高海拔多年冻土的分带原则，祁连山区多年冻土可以分为两类：过渡型(-0.5～一1.5℃)和不稳定型(0.5～ -0.5℃)，过渡型冻土基本处于连续多年冻土区内，以及岛状冻土区内高山、垭口地段，而各冻土岛均属于不稳定型。
多年冻土年是在特定地域的特殊外界条件下地气热量交换的产物，冻土地温、厚度等性质与冻土的分布地域具有一致性。祁连山多年冻土平均地温与其分布相对应，呈现出明显的高度地带性，决定地温的主导因素是海拔，海拔越高，年平均地温越低。图2拟合了年平均地温与高程的关系，大致呈线性，年平均地温随高程的变化率约为-0.27。C(100m)-1。
