祁连山植被垂直带结构，山地东西部南北坡不尽相同。
东段：北坡，植被垂直带谱(自下而上)：荒漠带(只有草原化荒漠亚带)—山地草原带—山地森林草原带—高山灌丛草甸带—高山亚冰雪稀疏植被带。
南坡，草原带—山地森林草原带—高山灌丛草甸带—高山亚冰雪稀疏植被带。
西段：北坡，荒漠带—山地草原带—高山草原带—高山亚冰雪稀疏植被带。南坡，荒漠带—高山草原带（限荒漠草原亚带）—高山亚冰雪稀疏植被带。
在5000m以上为高山冰雪带，4390~5000m为稀疏的高山垫状植物带，3300～4500m为山地荒漠草原带，3300m以下为戈壁荒漠带。高山垫状植物个体矮小，垫状体表面呈半圆形或球冠状，这种形状更有利于抗干旱、大风，并能获得更多的阳光和热能，减少自身热量的散失和水分的蒸发。高山草甸仅零星分布于山涧沟谷细粒土地段。在山地荒漠草原带内，由于强烈的蒸发和冻融作用，地表干燥，裂缝发育，局部地段盐渍化严重，植物种属以耐旱、耐碱的碱草、球草和芨芨草为主。戈壁荒漠带内气候极为干燥，地表以戈壁和流动砂丘为主，植被稀疏，仅在局部有水的地段发育着芦苇，水麦冬等植物。
山地森林
高山灌丛草甸
高山稀疏植被
高山灌丛草甸
