青藏高原湖泊星罗棋布,是我国湖泊数量最多,面积最大的地区。据统计仅青海、西藏两省区,面积大于1平方公里的湖泊有1019个,其中面积大于100平方公里的有63个,大于1000平方公里的有3个。全区湖泊总面积为36889平方公里,占全国湖泊总面积70989平方公里的52%。湖泊根据水系特点,可分为外流湖和内流湖两大类。其中外流湖区的湖泊235个,内流湖区的湖泊的储量5182亿立方米,占全国湖泊总储量的7077亿立方米的73.2%。
湖泊根据水化学特征,湖泊水可分为:淡水湖泊和咸水湖泊,湖泊总水量中,淡水储量为1035亿立方米,占总储水量的12.7%,湖泊以咸水湖和盐湖为主。